华人学者一作!绘制生命的功能蓝图:《Cell》首次构建人类细胞基因“社交网络”


理解成千上万个基因如何在细胞内协同工作,如同解读一部生命的“交响乐总谱”,是生物学和现代医学的核心挑战。基因间的相互作用——一个基因的功能如何被另一个基因的改变所影响——正是谱写这首交响乐的关键规则。

2026年4月27日,加拿大多伦多大学Charles Boone团队(Xiang Zhang为共同第一作者)在Cell 在线发表题为“Global genetic interaction network of a human cell maps conserved principles and informs functional interpretation of gene co-essentiality profiles”的研究论文,该研究成功绘制了首个接近全基因组规模的人类细胞遗传相互作用网络,揭示了从单细胞酵母到复杂人类细胞中,生命功能架构的深刻保守性。

构建图谱:在人类细胞中系统性“配对删除”基因

为了绘制这张基因“社交网络”,研究团队在人类单倍体细胞系HAP1中,利用了高效的CRISPR基因编辑技术,对近400万个基因对进行了系统性的组合敲除筛选。这就像是在一个庞大社区中,尝试两两关闭住户的家门,观察哪些组合会导致整个社区运行出现“一加一大于二”的故障(负向相互作用,如合成致死)或意外缓解(正向相互作用)。

网络洞察:生命功能组织的“分层模块化”原则

通过分析约89,000个高可信度的遗传相互作用,研究构建了一张清晰的基因关系网络。分析表明,人类基因并非独立工作,而是被组织成一个高度模块化、具有层次结构的功能网络:

底层模块对应具体的蛋白质复合物(如负责DNA复制的机器)。

中间层模块对应完整的生物通路(如合成某种必需物质的代谢途径)。

高层级模块则对应更广泛的生物过程或细胞器(如整个线粒体的功能)。

重要发现:从酵母到人,功能蓝图“一脉相承”

这项研究最引人注目的发现之一是,这种“分层模块化”的组织原则,与此前在简单的单细胞生物——酿酒酵母中绘制的全局遗传网络高度相似。这意味着,尽管历经数十亿年的进化,从最简单到最复杂的真核细胞,其内部功能单元的组织逻辑是保守的。这为利用酵母等模式生物来研究人类基因功能提供了更强的理论依据。

文章模式图(图源自Cell

应用价值:为精准抗癌提供新线索

该网络不仅具有基础科学价值,更为疾病研究(尤其是癌症)提供了全新视角。当前大规模的癌症细胞系依赖图谱(如DepMap)揭示了哪些基因对特定癌细胞的生存是“必需的”,但通常无法解释其背后的机制。本研究构建的遗传相互作用网络,恰好能为此提供功能性解读。通过对比,研究者能够推断出癌细胞特异性依赖某个基因的原因,可能源于其内部独特的基因突变背景所导致的“合成致死”效应,从而为发现新的抗癌靶点提供了强大工具。

总结而言,这项研究不仅提供了一张前所未有详细的人类细胞功能“接线图”,证明了生命功能架构的核心原则在进化中的稳定性,更架起了一座连接基础基因功能与疾病特异性依赖机制的桥梁,为未来开发更精准的疗法奠定了基石。

参考消息:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00345-4


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