Mol Cell:DNA修复的“分子刹车”,深圳大学朱卫国/田媛揭示PCBP1如何通过乙酰化状态控制PARP1的激活与关闭


Poly(ADP-核糖)聚合酶 1(PARP1)是一种DNA损伤传感器,也是DNA修复所必需的起始酶之一。理解如何调控PARP1活性对于制定维持基因组稳定性的策略至关重要。

2026年6月1日,深圳大学朱卫国和田媛共同通讯在Molecular Cell 在线发表题为Deacetylated PCBP1 licenses PARP1 activity for DNA damage repair的研究论文。该研究报告RNA结合蛋白多聚胞嘧啶结合蛋白1(PCBP1)在生理条件下与PARP1相互作用并抑制其活性,而这种抑制在DNA损伤应答的早期阶段被解除。

从机制上讲,组蛋白去乙酰化酶SIRT7介导PCBP1在K314和K351位点的去乙酰化,从而破坏其与PARP1的DNA结合结构域之间的相互作用,进而允许PARP1被激活。通过基因编辑或拮抗肽调控PCBP1的表达或乙酰化水平,可影响细胞和小鼠模型中DNA损伤修复的效率。

PCBP1水平降低与癌症患者接受放疗后生存率较差相关。PCBP1对PARP1活性的这种调控作用,可能为联合应用PCBP1去乙酰化抑制与DNA损伤剂的治疗策略奠定基础。

人类基因组持续受到内源性代谢物和外源性基因毒性物质的挑战,从而导致多种形式的DNA损伤。其中,DNA双链断裂(DSBs)是最致命的损伤类型,因为它会导致基因组不稳定性。为应对这些有害损伤,细胞进化出了DNA损伤应答(DDR)通路来进行修复。

在参与DDR信号传导和修复的因子中,多聚(ADP-核糖)聚合酶1(PARP1)在感知DNA损伤和启动修复相关信号传导中发挥着关键作用。在识别DNA断裂后,PARP1在自身、组蛋白和非组蛋白上合成不同长度的PAR链,从而通过局部染色质重塑、修复因子的募集以及转录调控来促进DNA修复。

鉴于PARP1在DNA修复和基因组维持中的重要作用,其活性必须受到严格调控,因为过度激活会导致细胞功能障碍并引发疾病。在生理条件下,存在多种机制维持PARP1处于非活性或基础状态,这些机制可能因细胞应激而被破坏。例如,驱动蛋白家族成员4(KIF4)和macroH2A1.1(mH2A1.1)分别从PARP1上解离,以响应膜去极化和热休克,从而促进其激活。

最近的研究表明,脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)在紫外线刺激下会与PARP1解离,从而促进环丁烷嘧啶二聚体的核苷酸切除修复。这些例子突显了PARP1在维持细胞稳态中的多方面作用。然而,在应答DSBs的过程中,PARP1的抑制作用是如何被解除的,其机制目前尚完全未知。

图1.全文总结图(摘自Molecular Cell

鉴于DNA损伤剂在癌症治疗中的核心作用,几种PARP抑制剂已被批准或正在作为化疗或放疗增敏剂进行临床试验。不幸的是,这些抑制剂与一些不良反应相关,包括神经毒性和心血管毒性以及继发性恶性肿瘤。因此,阐明调控PARP1活性内源性负调控的分子机制,可能会提供替代性的治疗策略。

值得注意的是,所有临床批准的PARP抑制剂均通过与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)竞争结合PARP1的催化结构域来发挥作用,从而抑制其自身PARylation及从DNA上的释放,最终导致PARP捕获。

新出现的证据表明,PARP1在DNA上的持续捕获是这些抑制剂在正常组织中产生细胞毒性效应的基础。由于PARP1与DNA的结合对于其在DDR过程中的激活至关重要,直接破坏这种相互作用(而非靶向其催化结构域)可能克服当前PARP1抑制剂的局限性,并提供替代性治疗机会。

除了直接的酶活性外,DDR蛋白的功能还受到翻译后修饰(PTMs)的调控,这些修饰可微调DNA修复反应。PTMs通过调节底物的定位、活性和蛋白质-蛋白质交互作用来赋予功能多样性。由于应激诱导的PTMs通常是快速且可逆的,因此靶向应激特异性PTMs(而非基础活性)的策略,可能最大限度地减少与长期化学抑制相关的毒性和细胞功能障碍。

在调控DNA修复中PTMs的酶中,依赖于NAD+的去乙酰化酶sirtuin家族显得尤为重要。Sirtuin 7(SIRT7)是组蛋白去乙酰化酶家族的一员,通过对组蛋白和非组蛋白底物的去乙酰化作用,在DNA修复中发挥关键作用。值得注意的是,SIRT7快速募集到DNA损伤位点在很大程度上依赖于PARP1。然而,SIRT7在DDR过程中是否对PARP1活性产生相互调控作用,目前尚不清楚。

RNA结合蛋白(RBPs)调控转录和翻译,并且它们也被认为参与了多种DNA修复过程。多聚(rC)结合蛋白1(PCBP1)是一种RBP,已被鉴定为一种肿瘤抑制因子,参与调控转录、mRNA加工和翻译。然而,PCBP1促进DSB修复的具体机制尚不清楚。

在本研究中,作者筛选了PARP1的调控因子,并确定PCBP1是生理条件下PARP1活性的负调控因子,它在DNA损伤后会迅速从DSBs位点被置换。其机制是,SIRT7介导的PCBP1去乙酰化破坏了PCBP1与PARP1 DNA结合结构域(DBD)的交互作用,从而促进DNA修复。

使用细胞穿透肽(CPPs)和基因工程小鼠来阻止PCBP1去乙酰化,均表现出放射敏感性增加,而PCBP1缺陷的小鼠则表现出对放射的抵抗力增强。与此一致的是,在接受放射治疗的宫颈癌患者中,低PCBP1表达与较差的生存率相关。

总之,该研究结果揭示了PCBP1是PARP1的内源性抑制因子,并确定了一个潜在的、用于提高DNA损伤性癌症治疗效果的治疗轴。

参考消息:https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(26)00314-X


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