Nat Chem Biol :破解细胞信号“新语言”,上海交通大学莫茜等团队绘制多巴胺化修饰图谱,并解读其抑制肿瘤生长的“关键指令”


多巴胺化修饰,即多巴胺与蛋白质中谷氨酰胺侧链的共价连接,代表了一类新近被鉴定的翻译后修饰。由于底物鉴定有限,与多巴胺化修饰相关的功能及分子机制在很大程度上仍未阐明。

2026年5月8日,上海交通大学莫茜,刘宇,杨雯隽,张书宇和中国科学技术大学臧建业共同通讯在Nature Chemical Biology在线发表题为Chemoproteomic profiling reveals histone H4 dopaminylation inhibiting cell growth的研究论文。该研究利用炔基功能化的多巴胺探针,开发了一种在全细胞系统中选择性富集多巴胺化蛋白的方法。

该方法提供了包含4,133个多巴胺富集候选蛋白的全面资源,并通过酸可裂解标签的肽段水平分析,鉴定出1,181个推定多巴胺化蛋白,其中包括组蛋白H4在Q27位点的多巴胺化修饰(H4Q27dop),作者进一步验证了该修饰。在功能上,H4Q27dop在神经母细胞瘤模型中作为转录抑制因子发挥作用,它阻断CEBPD在CCND1启动子区的结合,导致CCND1的转录下调,并继而抑制细胞增殖。

该研究结果既提供了多巴胺化底物蛋白的宝贵资源,也揭示了多巴胺调控神经母细胞瘤细胞生长的独特分子机制。

多巴胺是一种神经递质,对于调节运动功能、大脑奖赏系统、血管张力以及神经-免疫通信至关重要。然而,新近的证据表明,它在激素释放和胃肠蠕动等生物过程中也发挥着更广泛的作用。多巴胺信号失调还通过其与多巴胺受体(DRs)的交互作用、激活非氧依赖的HIF1α通路或诱导活性氧生成而参与肿瘤进展,这凸显了其多样的生理及病理作用。

除信号传导功能外,多巴胺还可通过一种称为多巴胺化的过程共价连接到底物蛋白上。这种翻译后修饰由转谷氨酰胺酶(TGM)介导,该酶催化多巴胺与谷氨酰胺残基的γ-羧酰胺基团连接。尽管早在2003年的早期研究已为小GTP酶的多巴胺化提供了间接证据,但对其他底物以及多巴胺化生物学功能的了解仍然有限。

组蛋白H3在Q5位点多巴胺化(H3Q5dop)的发现与成瘾性药物诱导的转录可塑性相关,这重新激发了人们对这种翻译后修饰的兴趣。然而,在药物成瘾之外,非组蛋白底物及其功能的鉴定在很大程度上仍未得到探索。全面鉴定其天然细胞环境中的多巴胺化蛋白,对于增进对多巴胺化生物学功能及机制的理解至关重要。

图1.全文总结图(摘自NatureChemical Biology

组蛋白H3多巴胺化的鉴定基于合理的假设,而大多数其他多巴胺化蛋白则是通过使用单胺衍生物单丹磺酰尸胺(MDC)进行通用筛选而发现的。鉴定这种特定修饰的挑战源于其他生物源胺类(如5-羟色胺和组胺)的高丰度,这些物质也含有伯氨基。

虽然基于抗体的富集策略(尤其是使用泛多巴胺化抗体的方法)将非常有效,但目前尚缺乏此类工具。因此,迫切需要替代方法来全面分析多巴胺化蛋白的图谱,并阐明其生理和病理作用。

基于活性的蛋白质谱分析涉及安装功能基团以探测酶蛋白,已成为化学蛋白质组学中的强大工具,能够鉴定翻译后修饰底物。在本研究中,作者开发了一种新型多巴胺衍生探针,用于分析活细胞中的多巴胺化蛋白。结合质谱分析,该方法在全细胞系统中通过作者的探针鉴定出4,133个候选蛋白和3,288条修饰肽段。

在这些底物中,作者验证了组蛋白H4在Q27位点的多巴胺化(H4Q27dop),这是一种普遍存在于不同组织和细胞系中的修饰。功能分析揭示,H4Q27dop在神经母细胞瘤细胞中介导转录抑制和生长抑制,其作用部分通过下调关键细胞周期调节因子CCND1实现。从机制上讲,这种修饰破坏了CEBPD在CCND1启动子上的结合,从而限制了其转录激活。

这些发现提供了全面且具底物特异性的多巴胺化蛋白列表,并在组蛋白H4多巴胺化与神经母细胞瘤肿瘤抑制之间建立了新的联系。

参考消息:https://www.nature.com/articles/s41589-026-02225-x


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